每年年末或隔年年初，基金會固定公布下一年的中小學人權教案徵選、鄭南榕研究論文徵選辦法。但今年關於「鄭南榕研究論文徵選」，基金會有重大的決策改變。

有鑑於當代社會對台灣民主自由和轉型正義等議題的持續投入，累積了豐富且深層的對話和討論，經基金會內部充分討論和董事會決議，鄭南榕基金會已推動11屆的「鄭南榕研究論文徵選」完成階段性任務，將停止辦理。

但接下來，基金會將新設「第一屆  鄭南榕研究獎助辦法」，並於2023年5月19日公布詳細獎助辦法。

「鄭南榕研究獎助辦法」將更聚焦鄭南榕和《自由時代》系列週刊，期許國內外青年學子與各界人士，透過基金會所提供之鄭南榕文物資料、《自由時代》系列週刊全文資料，持續深入和聚焦研究鄭南榕的思想與行動，透過更多元和跨世代的視角，發展以鄭南榕為中心的研究，與當代台灣和世界對話。